熒光染色是個麻煩的工作流程,辛苦染色樣品就為了獲得一張好的熒光圖片,如果成像沒做好、圖片沒拍好,那真的是血虧、白忙活。為什么要用熒光成像?如何用熒光顯微鏡拍攝才能獲得高質(zhì)量的熒光成像?今天我們就來給大家介紹一下。
1、熒光成像:現(xiàn)代實(shí)驗(yàn)室是不可少的技術(shù)
熒光染色工作流相對明場染色復(fù)雜,那為什么要用熒光成像呢?首先回歸基礎(chǔ)概念,熒光是一種光致發(fā)光現(xiàn)象,指某些物質(zhì)(如熒光探針)在一定波長激發(fā)光的照射下,在短時間內(nèi)發(fā)出比激發(fā)光波長更長、能量更低可見光的現(xiàn)象。
熒光成像具有高靈敏度和高特異性的優(yōu)勢,熒光探針可以特定性標(biāo)記細(xì)胞器等目標(biāo),非常適合進(jìn)行特定蛋白、細(xì)胞器等在組織及細(xì)胞中的分布的觀察,共定位和相互作用的研究,離子濃度變化等生命動態(tài)過程的追蹤等等,廣泛應(yīng)用于細(xì)胞生物學(xué)、神經(jīng)生物學(xué)、植物學(xué)、微生物學(xué)、病理學(xué)、遺傳學(xué)等各領(lǐng)域,是現(xiàn)代實(shí)驗(yàn)室標(biāo)配的檢測方案、成像方案。
熒光成像一般使用熒光顯微鏡進(jìn)行,根據(jù)不同的實(shí)驗(yàn)?zāi)繕?biāo),需要選擇不同型態(tài)的熒光顯微鏡,比如切片類樣品或水質(zhì)檢查等高倍觀察適合用正置熒光顯微鏡,培養(yǎng)皿、活細(xì)胞類樣品適合用倒置熒光顯微鏡,植物和模式生物等大樣品適合用體視熒光顯微鏡。
2、熒光顯微鏡的兩個核心部件
熒光的產(chǎn)生包含激發(fā)和發(fā)射兩個過程,在熒光顯微鏡中具體體現(xiàn)為熒光光源和激發(fā)塊兩個關(guān)鍵部件,已經(jīng)都整個在熒光臂(熒光模塊)中,沒有這兩個部件,熒光無從談起,這兩個部件不合適,熒光效果大打折扣。
(1)激發(fā)光源:主要包含以下兩個指標(biāo)
光源光譜覆蓋發(fā)射光譜:熒光探針在特定波段范圍才能被激發(fā),因此激發(fā)光源的光譜范圍要能匹配所觀察樣本中的熒光探針的激發(fā)特征。
發(fā)射光譜波段的強(qiáng)度:熒光信號一般較弱,需要使用較高亮度的激發(fā)光以產(chǎn)生較強(qiáng)信號的發(fā)射熒光信號。
(2)激發(fā)塊:用于形成特異性激發(fā)/發(fā)射的一組濾光片,一般包含以下三個
激發(fā)濾光片EX:濾過光源中特定波段的光,用以激發(fā)樣本中特定熒光探針
發(fā)射濾光片EM:允許熒光探針發(fā)射的特定波段的光通過
二向分色鏡DM:反射激發(fā)波段的光,透過發(fā)射波段的光。
3、成像“寧欠勿曝"是個坑,曝光盡量亮一點(diǎn)
看完上面的資料,大家應(yīng)該都對熒光顯微鏡有更好的了解了,下面我們來講成像拍照部分。
現(xiàn)在的熒光成像拍照基本都是用熒光顯微鏡搭配顯微鏡數(shù)字相機(jī)進(jìn)行的,但不少教學(xué)資料可能還停留在膠片時代,這些資料可能和數(shù)字相機(jī)不太對得上,典型的就是“寧可欠曝,也不要過曝",簡稱“寧欠勿曝"。舉個例子,上圖是一張JPG格式的欠曝的斑馬魚熒光圖片,看起來有點(diǎn)費(fèi)眼神。
通過后期調(diào)整亮度,斑馬魚的信號是增強(qiáng)了,但背景的雜訊和噪點(diǎn)也增強(qiáng)了,看起來很不干凈,色彩也出現(xiàn)了斷層。
膠片相機(jī)擅長表現(xiàn)暗部,因此才有“寧欠勿曝",而顯微鏡數(shù)字相機(jī)相反,不擅長表現(xiàn)暗部,如果圖片欠曝,那么有效信號就更可能跟背景噪聲混在一起,從而降低了圖片的信噪比,成像效果就會不理想。因此對于顯微鏡數(shù)字相機(jī)來說,樣品信號的曝光盡量亮一點(diǎn)會更好,這可以通過在明美顯微成像系統(tǒng)中增加曝光時間或增益實(shí)現(xiàn)。
4、選擇合適的熒光光源和激發(fā)塊
提升信號亮度
上面我們介紹過,熒光顯微鏡有兩個核心部件,熒光光源和激發(fā)塊。要提升熒光亮度,除了調(diào)整相機(jī)的曝光時間和增益,還要選擇高光強(qiáng)的熒光光源和合適的濾光片組。熒光光源典型代表是高壓汞燈,它可以在特定波長提供非常高的光強(qiáng),缺點(diǎn)是需要預(yù)熱,使用壽命較短,且在壽命用盡之前還會有亮度衰減問題,如果你的汞燈亮度不足,建議先看看ND濾鏡是不是調(diào)錯了,如果ND濾鏡沒錯,那可能就是壽命快到了,要換個燈泡或換掉整個熒光光源。
部分資料可能還將金屬鹵素?zé)袅袨闊晒夤庠?,雖然鹵素?zé)裟芨采w激發(fā)光譜,且使用壽命比汞燈更長,但用作熒光光源時光強(qiáng)是不足的,熒光信號弱,不適合用于數(shù)字成像。
現(xiàn)在我們有比汞燈和鹵素?zé)舳家玫臒晒夤庠?,LED熒光光源,比如寬光譜大功率LED熒光光源和四通道光源. LED熒光光源能提供接近汞燈的激發(fā)光譜和光強(qiáng),而且可以即開即用,亮度可以線性調(diào)整,省去了預(yù)熱、調(diào)ND濾鏡等一系列流程,使用更加方便,而且壽命還能達(dá)到汞燈等幾十倍甚至上百倍。
激發(fā)塊用于形成特異性激發(fā)/發(fā)射光譜,如果激發(fā)塊的參數(shù)和熒光探針的參數(shù)不匹配,就會導(dǎo)致樣品熒光信號弱,需要切換到合適的激發(fā)塊解決。另外激發(fā)塊還有個通光效率的參數(shù),一般進(jìn)口濾光片組的通光效率要比國產(chǎn)濾光片組好幾十個百分比,熒光信號顯著更強(qiáng),背景更暗,信噪比更高,但對應(yīng)地成本也會高很多,明美選用進(jìn)口濾光片組裝熒光激發(fā)塊,在保障良好的激發(fā)效果前提下,有效降低了成本,并且除了BGUYR等常用波段,還有針對結(jié)核檢查的寶藍(lán)B2和針對熒光原位雜交FISH的藍(lán)綠雙通等特殊配置,大大提升了病理檢查等成像應(yīng)用的效率。
5、使用高靈敏度相機(jī)和色階/曲線
提升信噪比
數(shù)字相機(jī)隨著增益值提升和曝光時間的增加,會有不同程度的背景噪聲和熱噪聲問題,使用高靈敏度相機(jī)可以用更低的曝光時間實(shí)現(xiàn)理想的曝光,這不僅更方便拍攝未固定的樣品,還能帶來更高的信噪比,因此熒光成像一般推薦用高靈敏度相機(jī)。
熒光成像通常多多少少會有背景熒光問題,使用熒光擋板遮擋明場聚光鏡,能減少落射熒光成像時的背景熒光,而在數(shù)字相機(jī)成像時,我們可以通過調(diào)整明美顯微成像系統(tǒng)的色階或者曲線設(shè)置,實(shí)時壓低或去除背景熒光信號,再拍照。比如色階處理中,我們通常把滑條左下的滑塊往右調(diào),來去除背景熒光信號,然后將中間滑塊往左調(diào),適當(dāng)補(bǔ)償樣品信號,即可獲得高信噪比的成像。
6、圖片格式用TIFF更保險
在一開始的例子中,我們特別強(qiáng)調(diào)了JPG格式,那是不是用其他格式會更好?還真的是。
通過簡單后期處理,我們還是可以獲得一張能用的樣品圖。這是因?yàn)镴PG文件格式會將暗部細(xì)節(jié)和高光細(xì)節(jié)等人眼不善于分辨的內(nèi)容丟掉,來壓縮數(shù)據(jù)量,這里面可能就包含對我們有用的樣品細(xì)節(jié),而TIF格式可以儲存未壓縮的原始數(shù)據(jù),這些數(shù)據(jù)經(jīng)過處理還是有機(jī)會用得上的,這也是論文圖片通常用TIF格式的原因。